La sede principale del Dipartimento di Scienze Veterinarie (ex Facoltà di Medicina Veterinaria) è stata inaugurata nel 1965 e si trova a Pisa in Viale delle Piagge 2.

Il 1 marzo 2000 è stato inaugurato a San Piero a Grado il primo lotto della sede del Dipartimento di Scienze Veterinarie: il progetto prevede di trasferire l'intero Dipartimento a seguito della costruzione di nuovi edifici. Attualmente nella sede di San Piero a Grado è operante l'Ospedale Didattico Veterinario (ODV).

Oltre a queste due sedi principali, esiste un'altra sede distaccata (il Podere delle Querciole).

La sede di Pisa può essere raggiunta in auto, Autostrada A12 - uscita Pisa centro, o in treno, Stazione di Pisa Centrale,  ed autobus (linea n. 14) o a piedi (circa 15-20 minuti).