Gabriele Spatola Contatti: gabriele.spatola@phd.unipi.it ORCID: https://orcid.org/0009-0004-0413-2614 Supervisori tesi: Prof. Andrea Armani Titolo Progetto: Tecnologie di sequenziamento di nuova generazione (NGS) a supporto di tracciabilità, igiene e sicurezza degli alimenti Abstract: Le tecnologie di sequenziamento di nuova generazione (Next Generation Sequencing – NGS) rappresentano strumenti estremamente potenti in grado di sequenciare ed analizzare simultaneamente milioni di molecole di DNA, aprendo nuove prospettive anche nel campo della sicurezza e della tracciabilità degli alimenti. Tra le tecniche NGS più diffuse e promettenti si annoverano il Metabarcoding (amplicon sequencing), il Whole Genome Sequencing (WGS) ed il Whole Genome Shotgun (Shotgun). Tuttavia, l’implementazione e la standardizzazione delle tecniche NGS a supporto di tracciabilità, igiene e sicurezza degli alimenti risulta ancora limitata. Il presente progetto di ricerca si propone di applicare le tecnologie NGS per rispondere concretamente alle esigenze del settore agroalimentare, sviluppando protocolli specifici e mirati all’autenticazione degli alimenti, alla caratterizzazione del microbiota e all’individuazione di microrganismi di interesse ispettivo, sia in diverse matrici alimentari che negli ambienti di produzione. Nello specifico, verranno sviluppati protocolli di laboratorio (Wet-lab) e pipeline bioinformatiche (Dry-lab) specifici per diverse tipologie di matrici alimentari ed obiettivi di analisi. Infine, il progetto prevede la collaborazione con i laboratori ufficiali per la validazione sperimentale dei protocolli sviluppati, promuovendo così un trasferimento tecnologico concreto e applicabile alla realtà operativa. Pubblicazioni: Spatola, G., Giusti, A., Mancini, S., Tinacci, L., Nuvoloni, R., Fratini, F., … & Armani, A. (2024). Assessment of the information to consumers on insects-based products (Novel Food) sold by e-commerce in the light of the EU legislation: when labelling compliance becomes a matter of accuracy. Food Control, 162, 110440. Giusti, A., Spatola, G., Mancini, S., Nuvoloni, R., & Armani, A. (2024). Novel foods, old issues: Metabarcoding revealed mislabeling in insect-based products sold by e-commerce on the EU market. Food Research International, 184, 114268. Spatola, G., Giusti, A., & Armani, A. (2024). The “Dry-Lab” Side of Food Authentication: Benchmark of Bioinformatic Pipelines for the Analysis of Metabarcoding Data. Foods, 13(13), 2102. Spatola, G., Giusti, A., Gasperetti, L., Nuvoloni, R., Dalmasso, A., Chiesa, F., & Armani, A. (2025). 16S rRNA metabarcoding applied to the microbiome of insect products (novel food): a comparative analysis of three reference databases. Italian Journal of Food Safety. Comunicazioni orali a congresso: G. Spatola, A. Giusti, S. Mancini, L. Tinacci, R. Nuvoloni, A. Armani. “Insects-Based Products (Novel Food) Sold by E-Commerce: Assessment of the Information to Consumers in the Light of the EU Legislation”, SISVET 2024, Parma (PA), 12–14 Giugno 2024 G. Spatola, A. Giusti, L. Gasperetti, R. Nuvoloni, A. Dalmasso, F. Chiesa, A. Armani. “Metabarcoding del gene 16S rRNA applicato al microbioma di prodotti a base di insetti (Novel Food): analisi comparativa di tre database di riferimento”, AIVI – XXXIII Congresso dell’Associazione Italiana Veterinari Igienisti, 11–13 Settembre 2024, Castellammare di Stabia (NA)